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熒光定量Q-PCR檢測知識“大攻略”!
更新時間:2019-03-18   點擊次數(shù):2180次
   熒光定量Q-PCR檢測知識“大攻略”!
  熒光定量Q-PCR檢測的理論依據(jù)是什通過特定的待擴增基因片段起始含量越大,則指數(shù)擴增過程越短,當(dāng)擴增速率趨于穩(wěn)定后,則無論原來樣品中起始模板含量多少,終擴增片段的含量通常是一樣的。
  理想的擴增結(jié)果:Y=X×2n;
  其中Y代表擴增產(chǎn)物量,X代表PCR反應(yīng)體中的原始模板數(shù)n為擴增次數(shù);理論上PCR擴增效率為100%,PCR產(chǎn)物隨著循環(huán)的進行成指數(shù)增長,但實際上:DNA的每一次復(fù)制都不*,即每一次擴增中,模板不是呈2的倍增長;實際應(yīng)為:Y=X(1+E)n,其中E代表擴增效率:E=參與復(fù)制的模板/總模板,通常E≤1,E在整個PCR擴增過程中不是固定不變的。通常X在1-105拷貝、循環(huán)次數(shù)n≤30時,E相對穩(wěn)定,原始模板以相對固定的指數(shù)形式增加,適合定量分析,這也就是所謂的指數(shù)期;隨著循環(huán)次數(shù)n的增加(>30次),E值逐漸減少,Y呈非固定的指數(shù)形式增加,后進入平臺期。
  熒光定量Q-PCR檢測的理論模式:
  PCR是對原始待測模板核酸的一個擴增過程,任何干擾PCR指數(shù)擴增的因素都會影響擴增產(chǎn)物的量,使得PCR擴增終產(chǎn)物的數(shù)量與原始模板數(shù)量之間沒有一個固定的比例關(guān)系,通過檢測擴增終產(chǎn)物很難對原始模板進行準(zhǔn)確定量。
  PCR擴增通式:
  1.Tn=T0(1+E)n;
     2.Tn=Tn-1(1+E)n。
  注:[0其中E表示擴增效率,n為循環(huán)數(shù),Tn表示在n個周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量,Tn-1表示在n-1個周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量,T0為原始模板數(shù)量。設(shè)定PCR到達(dá)指數(shù)擴增期時,產(chǎn)生一定的熒光(熒光依賴于某一循環(huán)擴增產(chǎn)物的總量,即特定的拷貝數(shù)K,為常數(shù),大約在1010左右)高于背景為儀器所識別,此時的循環(huán)數(shù)為CP,也就是K=T0(1+E)CP,取對數(shù)即:
  lg K=lg T0+CP*lg(1+E);
  CP=-1/lg(1+E)*lg T0+lgk/lg(1+E)。
  由于對一特定的PCR而言,E與K均為常數(shù),故上式為循環(huán)數(shù)(CP)對原始模板拷貝數(shù)的對數(shù)(lg T0)一次方程,其標(biāo)準(zhǔn)形式y(tǒng)=kx+b,該直線的斜率為-1/lg(1+E),在橫坐標(biāo)上的截距為lgk/lg(1+E),也是熒光定量PCR所謂的標(biāo)準(zhǔn)曲線。
  根據(jù)PCR擴增過程中是否加入某種標(biāo)記物、標(biāo)記物的種類以及后檢測的信號的不同可分為四種類型:
  直接定量檢測法;同位素標(biāo)記定量;酶標(biāo)記定量檢測法;熒光定量Q-PCR技術(shù)。
  熒光定量PCR主要原理發(fā)射波長與受體熒光染料光染料吸收供體熒光傳遞的能量而激發(fā)出另一波長的熒光,同時將供體熒光淬滅。
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